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解決方案

激光技術與基因測序:窺探生命的密碼

來源:神奇激光世界-長春新產業(yè)2020-12-07 我要評論(0 )   

基因測序基因測序是一種新型基因檢測技術,簡單來說,就是將DNA/RNA分子中堿基ATGC的排列順序顯示出來?;驕y序技術能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,從而鎖定個...

基因測序

基因測序是一種新型基因檢測技術,簡單來說,就是將DNA/RNA分子中堿基ATGC的排列順序顯示出來?;驕y序技術能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,從而鎖定個人病變基因,提前預防和治療。

1977年,Walter Gilbert和Frederick Sanger建立了DNA測序技術,并于1980年獲得諾貝爾化學獎。由此開始,這項在未來主導生命科學領域發(fā)展的技術開始被廣泛應用于研究工作中。

至今為止的四十多年時間內,基因測序進行了多次技術變革。而激光熒光技術則在基因測序的發(fā)展中擔任了關鍵的角色。

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第一代基因測序技術(Sanger測序)是基于Sanger雙脫氧終止法的測序原理,結合熒光標記和毛細管陣列電泳技術來實現(xiàn)測序的自動化,基本方法是鏈終止或降解法。該方法隨后改用熒光核苷酸標記、毛細管電泳區(qū)分和激光檢測,從而實現(xiàn)了第一代自動化測序法。

雖然第一代DNA測序技術測序讀長可達1000bp,準確性高達99.999%,但由于其高成本、低通量,所以影響了大規(guī)模的應用。

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第二代基因測序技術(Next-generation sequencing,NGS)以舍棄讀長為代價 實現(xiàn)了高通量測序 ,一次運行即可同時得到幾十萬到幾百萬條核酸分子的序列。

第一代測序為合成終止測序,而二代測序開創(chuàng)性的引入了可逆終止末端,從而實現(xiàn)邊合成邊測序。在DNA復制過程中通過激光激發(fā)熒光信號,掃描捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標記(一般為熒光分子標記)來確定DNA的序列。

第二代基因測序憑借著高通量、低成本、測序時間短等優(yōu)勢,很快在全球測序市場中占據(jù)了主導地位,其應用領域包括無創(chuàng)產前檢測(NIPT)、胚胎植入前遺傳學診斷/篩查(PGD/PGS)、遺傳病診斷、腫瘤診斷和個性化治療、致病基因檢測、病原微生物檢測等。

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第三代DNA測序技術主要包括:Helico Bioscience單分子測序技術、Pacific Bioscience單分子實時(Single molecule realtime,SMRT)測序技術和Oxford Nanopore納米孔單分子測序技術(通過納米孔帶來的“電信號”變化實時測序)3種。

與前兩代測序技術相比,其最大的特點就是單分子測序,測序過程無需進行PCR擴增,并且理論上可以測定無限長度的核酸序列。 因此第三代測序技術又稱為單分子DNA 測序,即通過現(xiàn)代光學、高分子、納米技術等手段來區(qū)分堿基信號差異的原理,以達到直接讀取序列信息的目的。 不需要使用生物或化學試劑,能夠進一步降低成本。

而目前第三代測序最大的問題是錯誤率較高(15-40%)。 但出錯是隨機的,并不會像第二代測序技術那樣存在測序錯誤的偏向,因而可以通過多次測序來進行有效的糾錯。

對比三代基因測序,小編腦海里浮現(xiàn)了一個大膽的比喻

圖三可能只有北方朋友才能秒懂

激光器&基因測序

能否通過激光高效激發(fā)分別針對四種 DNA核苷酸(ACGT)化學標記的熒光,能否精準地區(qū)分四種熒光染料,這些對于基因測序來說至關重要。 所以, 激光器的選擇會直接影響 測序的準確性和 高效性。

1、激光波長:

目前基因測序市場常用波長:488 nm、514 nm、532 nm、577nm、639nm、660 nm、690nm......

長春新產業(yè)—基因測序專用激光器

2、激光功率:mW級到W級。

(1) 對于DNA單鏈被高度放大、空間上高度集中的應用來說,熒光信號更強,所需激光器功率更低;

(2)對于取樣點遍布需要大面積照明的大型流動池或滑道中,就會需要較高功率;

(3)因為短波長(如488nm)更容易對樣品造成功能性損傷,所以 會選擇較低功率。

3、穩(wěn)定性:

基因測序實驗及應用中,對激光器的可靠性以及長期工作的功率穩(wěn)定性要求很高,如果激光器的功率偏差很大,會直接影響測試的整個數(shù)據(jù)集。

長春新產業(yè)488nm—4小時功率穩(wěn)定性(均方根值)

4、可定制的解決方案

在公司或高校的研發(fā)及實驗中,除了對激光器的光學參數(shù)要求外,更需要的是“定制化”的解決方案。簡單一些的如光纖傳輸、光斑整形,復雜一些的如多波長合成,多個波長之間高一致性等等。

長春新產業(yè)—多波長激光器(可定制)

敲重點

長春新產業(yè)的激光器具有高穩(wěn)定性、小體積、低功耗、風冷/傳導散熱等特點。目前,長春新產業(yè)用于基因測序的激光器已實現(xiàn)量產,每年為測序儀制造商批量供貨。針對客戶實驗/設備需求,我們可提供:

1、 特 殊波長激光器: 如 550nm、561nm、 577nm、589nm、 607nm、639nm ......

2、多波長激光系統(tǒng):

(1)光纖耦合輸出,整體功率可達8W以上,且支持功率微調;

(2)長時間工作的功率/波長穩(wěn)定性好:100小時功率穩(wěn)定性<3%,100小時所有波長穩(wěn)定性±0.1nm;

(3)光譜純度高;

(4)光束能量勻化,消散斑效果顯著;

(5)開關光時間極短,可達百納秒量級,可獨立/同時開關光;

(6)支持RS232接口控制,滿足不同客戶整合要求。

3、定制的光學方案。

長春新產業(yè)—定制化解決方案

除基因測序外,該系列激光器同時被廣泛應用于PCR、流式細胞術、生物顯微成像等生物領域中。


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激光技術激光器
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