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激光顯微切割等技術繪制小鼠早期胚胎三維分子圖譜

星之球激光 來源:中國科學報2016-03-24 我要評論(0 )   

  中科院上海生科院生物化學與細胞生物學研究所景乃禾研究組與中科院馬普學會計算生物學伙伴研究所韓敬東研究組合作,研究結合激光顯微切割以及單細胞測序等先進技術...

  中科院上海生科院生物化學與細胞生物學研究所景乃禾研究組與中科院—馬普學會計算生物學伙伴研究所韓敬東研究組合作,研究結合激光顯微切割以及單細胞測序等先進技術,繪制了小鼠早期發育原腸運動中期精細的胚胎三維分子圖譜,并揭示了小鼠細胞譜系藍圖建立過程中的空間轉錄組特征、轉錄因子和信號通路調控網絡。相關研究成果今天在線發表于《發育細胞》。
  科研人員建立了基于激光顯微切割和單細胞轉錄組測序的空間轉錄組分析方法,完成了小鼠原腸運動中期(E7.0)單個胚胎組織切片位置特異的轉錄組測序。他們發現并鑒定了許多新的胚層特異標記基因,構建了全胚胎基因表達三維分子圖譜,使得小鼠這一時期兩萬多個基因的表達能夠以電子原位雜交的形式得到完全呈現。同時,該工作還鑒定了一組能夠代表E7.0時期發育狀態和特異空間結構域的標志基因,可將外源的多能干細胞或胚胎組織細胞“投遞”到體內胚胎的特定位置,從而將未知來源的干細胞定位于體內胚胎的相應部位。
  專家認為,該研究為認識干細胞的全能性與分化潛能以及干細胞轉化醫學應用提供了全新的視角和理論指導。
  據悉,該項研究工作是與國際著名發育生物學家、英國皇家科學院院士、澳大利亞悉尼大學教授Patrick Tam合作完成的。

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激光顯微切割單細胞測序三維分子圖譜
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